＞hogeさん
最新版(1.42p)で試してみましたが、症状を再現できません。
hogeさんの環境のAnHttpdのバージョンはいくつでしょうか？
".."の扱いに関しては近いものではVer1.40などでも修正されています。
最新版にしても同様の症状が発生する場合、何か変わった設定をなさっているのであれば
レジストリのKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\AnHttpd以下を書き出し、中田さんに主旨連絡をメールでされたほうが良いかもしれません。
セキュリティーホールなのかバグなのかは分かりませんが、
http://URL/../
というようにURLに../をつけるとanhttpdが強制終了してしまいます。
こうなると落とすのも簡単になるので修正をお願いします。