中田さん、早速のアドバイスをいただき痛み入ります。
ご指摘どおりconfig.inc.php の $cfg['PmaAbsoluteUri'] の個所が間違って入力されて
おりました。
お手数をかけまして申し訳ございませんでした。今後とも宜しくお願いいたします。
ボンさん、
どういうCGIファイル(.php)へのアクセスで404エラーになっているのかを調べるのが普通でしょう。AN HTTPD のエラーログを見てみればそれはわかると思います。
対応はその内容次第だと思いますけど、関係するとすれば config.inc.php の $cfg['PmaAbsoluteUri'] あたりではないのでしょうか（？）。
そこを「空にしておく場合は、編集や保存をして自動検出がはたらくかどうかテストしてみなさい」と書いてありますし。
web serverに関して困った時は大変重宝させていただいております。
さて、phpMyAdminですが、version2.4.0-rc1と2.3.0両方とも試しましたが、変更、削除を
行うと、「Error 404 見つかりません - CGIスクリプトまたはプログラムがありません」とメッセージがでます。但し、結果的には変更も削除も行われております。
web serverはAN HTTPD+MySQL+php+activeperlをinstallしております。
お気づきの点がありましたら、ご指摘をいただければ幸甚です。