yasu さん、
インデックスリストで複数出るのは、重複をみていないからです。
オプションというより、ひとつしか出ないようにしようと思います。
アクティブになるまで初期化中なのも、自分でアクティブになるようにしましょう。
お久しぶりです。
気になった点、書き込ませて頂きます（既出でしたらすみません）
エイリアスはサブディレクトリは対応していないのでしょうか？
/test/aaa
/test/bbb
こんな感じで追加したときにルートのインデックスを表示させると、
testが複数出現するようです。
出来れば個別に隠す(インデックスに表示しない)オプションがあればと思います。
あと、起動時に非アクティブだと最小化せずにアクティブになるまで
初期化中になるみたいですがこれは仕様かな？
環境はWin98です。