AN HTTPDとフォルダ構成の件、納得しました。
ありがとうございました。
偏西風さん、
サーバの動作上の違いはありません。
考えるとすればセキュリティ上の問題になると思います。
The World Wide Web Security FAQ（日本語版） の Q32 やその前後も参考にしてください。
AN HTTPDの使い方に付いておたずねします。
中田先生のページからリンクされたサイトには具体的に使い方が載っていますが、
わからないことがあります。
つまり、AN HTTPDをローカルサーバにして、あるCGIプログラムをテストする場合、
perl言語で書かれたCGIプログラムを、AN HTTPDをインストールしたフォルダの下に
置く場合と、
AN HTTPDをインストールしたフォルダと、perl言語で書かれたCGIプログラムとを、まったく別々のフォルダに置く場合とでは、何か意味が違うのでしょうか？
二通りのテストはしてみました。
どちらもOKでした。
どちらのやり方が良いのでしょうか？