Microsoftがネットワークで配布しているPowerToyというWindows95用のソフトがあるのですが、その中にQuickResという画面の大きさや色数を即座に変更するツールが入っています。このツールで色数を変化させるとチューチューマウスの走る姿のカーソルが黒くなったりします。
Ver1.4で一応の対処をしますが、QuickResを使わずに画面のプロパティで色数を変更するとWindowsの再起動を求めてきます。Windows95で画面サイズの変更は再起動なしに変更できますが、色数の変更は再起動しなければならない仕様になっているはずです。このQuickResは色数の変更も再起動なしに行ってしまうため、実行中のソフトに問題が出てしまいます。
もしカーソルが黒くなったらチューチューマウスを再起動してください。