| 情報交換 |
| 装置メーカー |
| ソフトウエア |
| 試薬 |
| ベンダー |
| 総合的サービス |
| 受託製造 |
| 研究室等 |
| Opinion(アレイについての私的雑感) |
| 論文の斜め読み(ミニ・レビュー) |
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| 情報交換 | go_top | |
| 日経バイオテク | ||
| www.Gene-Chips.com | アレイに関する包括的なリンク集 | |
| Microarray & Data Analysis | アレイのデータ解析関連の論文のリスト | |
| A collaborative project led by Virginia Tech and the Forest Biotechnology Group at North Carolina State University | ||
| The Stanford microarray database | Stanfordの統合マイクロアレイ・データベース | |
| MGED group | アレイによる発現解析のデータ記述の規格策定を目指すグループ.MIAMEを提唱している. | |
| Rice Microarray Openning Site | イネ (RGP) | |
| Torrey Mesa Research Institute | イネ等 (NADII) | |
| Arabidopsis Functional Genomics Consortium | アラビドプシス | |
| The TIGR Potato Genome Project | バレイショ (ポテトChips) | |
| ZmDB: Maize Genome Database | トウモロコシ | |
| 日本バイオインフォマティクス学会 (アレイインフォマティクス研究会) | ||
| DNAmicroarray.org | 坊農さん主催のDNAマイクロアレイ関連のサイト | |
| 装置メーカー | go_top | |
| アレイリーダー | go_top | |
| Affymetrix | Affymetrix方式 | |
| Agilent Technologies | 光源はレーザー,検出器はCCD?,光学系は共焦点?,オートローダー(48検体)内臓,高分解能(5micrometer),ハイブリダイゼーションチャンバーのおまけ付き,らしい | |
| Applied Precision | 大量処理向け!励起波長の選択範囲が広い (レーザーを使わない),検出器は冷却CCD 新製品(廉価版?)も登場 |
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| AXON instulments,国内代理店インターメディカル | 光源はレーザー,検出器はPMT,非共焦点,光学フィルター:海外ではAmaersham Pharmacia BiotechへOEM | |
| 富士フィルム | 光源はレーザー、検出器はPMT、光学系は共焦点−非共焦点切換 | |
| GeneFocus | ||
| Genetic Micro Systems (GMS)(Affymetrixに吸収された) | 光源はレーザー,検出器はPMT,光学系は共焦点 | |
| Genomic Solutions (GS) | ||
| GSI Lumonics (GSI) | ||
| 日立ソフトウエアエンジニアリング | 光源はハロゲンランプ,検出器は冷却CCD,光学フィルター使用 | |
| Hyseq | Affymetrix方式 | |
| Molecular Dynamics (MD) | 光源はレーザー,検出器はPMT,光学系は共焦点 | |
| Nanogen | センサーチップ・アレイ | |
| 日本レーザー電子 (NLE) | 光源はレーザー,検出器はPMT,光学フィルター 超高速Array scannerも登場 |
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| Scanalytics | ||
| Tecan Japan | LS Scanner スライド・ホルダーはマイクロプレートと同サイズで、ロボットアームによるハンドリングが可能。 |
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| Virtek vision international | スキャンが高速,レーザーは5波長まで対応 | |
| スポッター | go_top | |
| BioRobotics,池田理科 | ||
| Cartesian Technologies | 500万円のスポッター,インクジェット・プリンタ方式等 | |
| Cytonix Corporation | ||
| Genemachines | ||
| Genetic Micro Systems (GMS) | ||
| 日立ソウフトウエアエンジニアリング | SPBIOIIになった | |
| 日本レーザー電子 (NLE) | 350万円のスポタッター | |
| カケンジェネティクス | アレイの受託製造も行っている | |
| ニチリョー | CHOT(チョット)シリーズ,パッケージ3 | |
| ニップンテクノクラスタ | 2003/06/03開設 | |
| Packard instulment company | インクジェット・プリンタ方式 | |
| Rosetta Inpharmatics, Inc | インクジェット・プリンタ方式 | |
| TeleChem International | ||
| ソフトウエア | go_top | |
| Applied Maths | アレイの解析ツール以外に各種のbioinfomatics関連のツールがある. | |
| BioDiscovery, Inc,宝酒造 | アレイ設計,発現解析各種 | |
| 富士フィルム | Array Gaugeなど | |
| GeneData AG | ||
| Gene Logic | ||
| インフォコム,Umetrics | 主成分分析,PLSをサポート(SIMCA-P) Applied Mathnの製品も扱っている.アレイの解析よりは,メタボローム解析の方面で有効性を発揮しそう. |
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| Media Cybernetics, Array-Pro Analyzer | スポットの数値化ソフトとしてはなかなか. | |
| Mind Ware | SOM専用ツール(Viscovery SOMine).使い勝手にちょっと癖がありますが,SOM専用ソフトとしては良くできています.ただしHelpファイルの訳は不出来. | |
| Molmine | J-Express: Javaで書かれた発現解析ツール。大変よくできている.Academic usersは無料で利用できる.ver. 2.1に改訂。 | |
| 日本レーザー電子 (NLE) | ||
| Research Genetics | ||
| Rosetta Bio Software | Rosetta resolver system,発現解析データベースシステムというより,もはや発現プロファイルと連動する知識ベース(Knowledge Base)システム。きわめて多機能だが,使いこなす側の能力が問われそう。 (横河アナリティカル高田様,箕浦様,情報提供ありがとう御座います) | |
| SAS institute Japan | JMP:統計パッケージ・ver.4.0.4からSOMをサポート.日本語版もついに出ました.私はこれを愛用していますが,SOMの分類能力にはちょっと疑問. | |
| Silicon Genetics | 代理店 | |
| Spotfie | 可視化ツール | |
| ワールド・フュージョン,InforMax | 発現解析ツール(Xpression NTI)など. | |
| Xanagen | アレイの解析ツールではありませんが,Batch Learning SOMを採用した自己組織化マップツールを開発しています。 | |
| 番外 | GEML | 遺伝子発現データ記述用のXML |
| 試薬 | go_top | |
| 標識試薬他 | ||
| Amersham Pharmacia Biotech | Cy-5,Cy-3, 標識キット | |
| Clontech | 標識キット | |
| Invitrogen | 標識キット | |
| 第一薬品(NEN) | 第一薬品(Cy-5,Cy-3) | |
| 宝酒造 | Label-It,RNA labeling | |
| ベンダー | go_top | |
| アマシャム・ファルマシア | AffymetrixとMD | |
| BM機器 | GSIの製品 | |
| エムエス機器 | Virtek vision internationalの製品 | |
| 宝酒造 | GMSとBio Discoveryの製品 | |
| 総合的サービス | (データベース等Informaticsまでを包括) | go_top |
| Agilent Technologies | インクジェット方式のオリゴまたはcDNAアレイ製造,解析 | |
| アマシャム・ファルマシア | ||
| GeneData AG | 発現解析サービス(2001/02/19) | |
| GENOMETRIX | 受託分析 | |
| 日立ソウフトウエア | ||
| クラボウ,Incyte | ||
| 日本レーザー電子 (NLE) | オリゴ・アレイの受託 | |
| ノバスジーン | 発現解析・SNPs解析 | |
| Rosetta Inpharmatics, Inc | ||
| 受託製造 | (製造・読み取り・画像解析まで) | |
| アジレントテクノロジーズ | 受託製造 | |
| クロンテック | 受託製造 | |
| ディスカバリー・バイオテクノロジーズ株式会社 | 受託製造 | |
| DNAチップ研究所 | 受託製造 | |
| 北海道システムサイエンス | 受託製造 | |
| 国際試薬株式会社 | 受託製造 | |
| 国産化学株式会社 | 受託製造 | |
| 日清紡 | 受託製造 | |
| Promega | 受託製造 | |
| シグマジェノシスジャパン株式会社 | 受託製造 | |
| SciMedia | 受託製造・解析(2001/06/18) | |
| 寶バイオ | 受託製造 | |
| 東洋紡 | 受託製造 | |
| 研究室等 | go_top | |
| 東京大学医科学研究所 ヒトゲノム解析センター 中村研究室 |
マイクロアレイについての丁寧な技術的解説とプロトコルのPDFファイル | |
| Patrick O. Brown lab located at Stanford University | 元祖マイクロアレイ(出芽酵母) | |
| Terry Speed's Microarray Data Analysis Group Page | Micoarrayのデータ解析に関わる統計的な問題点がよく整理されている. | |
| 京都大学化学研究所金久研究室 | ||
| 九州大学大学院 生物資源環境科学研究科 遺伝子資源工学専攻 遺伝子制御学 研究室 |
酵母のアレイ | |
| NHGRI Microarray Project: Home Page | ||
| Stanford Breast Cancer Microarray Project | ||
| The Whitehead/MIT Genome Center's Molecular Pattern Recognition web site | パターン認識 | |
| 国立小児病院小児医療研究センター | 改組:追跡中 | |
| MOLECULARONCOLOGY AND DEVELOPMENT in the Department of Molecular Biotechnology at the University of Washington |
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| Gene Expression Data Analysis | Department of Biostatistics & Medical Informatics University of Wisconsin | |
| 将来キーとなるかもしれない技術に関するリンクを開拓? | surface plasmon resonance (SPR) 標識の必要がない.高速である. プローブとターゲットのホモロジーの情報がえられる.等のメリットが期待される.アレイの高密度化と製造技術に課題. |