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遺伝子の仕組みや研究を教えて

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  「遺伝」とは、親から子に、体の形や色などの「形質」が伝わる現象のこと。

 遺伝する形質(親からの形質の受け継ぎ)を決めるものの代表が 「遺伝子(gene)」
 多くの生物で遺伝情報を左右しているのは、遺伝子を構成する「デオキシリボ核酸(DNA)」の分子内にある4種類の塩基配列DNA4種類の塩基配列がたくさんつながった螺旋状のなが〜くほそ〜い鎖の形をしています。DNAを主体とする遺伝子のは、塩基性のインクで色づきやすいので 「染色体」と呼ばれています。

 細菌やミトコンドリアの遺伝子はわっかの形をしています(プラスミド)。
 遺伝子が複雑だと高等生物、というわけではないようで、ヒトの染色体は23組の46本だけど
  アオカビ=2本 金魚=94本 ヤドカリ=254本!
なのだそうです。

 図解なしに延々説明を書いてもよけいわけがわからないばかりかも。
 リンク集に、わかりやすい図解付きサイトへのリンクがありますし、入門書を読んでおくのもいいでしょう。

※ ハプロタイプ=「一塩基多型」(SNP)の集まり
※ プロテオミクス=たんぱく質の構造、位置、相互作用、機能などの研究

●質問:DNAは子供の時も大人の時も同じなのでしょうか?
 チョウやカブトムシのように、幼虫・さなぎ・成虫で姿が変わる生物でも、DNAは同じままで成長しているのでしょうか?

● 答:DNAは成長につれて順々に作動のしかたを変えていくので、 それなりに思春期を迎えたり脱皮したり変態したり更年期を迎えたりします。
  同じキーボードが、押す場所によって違う和音を出す、みたいなもんです。
関連項目:
* 「メンデルの法則」   * 「遺伝子還元論」 遺伝子決定論
* 「バイオエシックス」「生命倫理」   * 「遺伝子治療」「遺伝子診断」「遺伝病」
* ゲノム創薬 オーダーメイド医療  * 進化医学
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Q:ヒトゲノムプロジェクトで解析したDNAは、 誰から採ったものですか?
A:大半はクレイグ・ベンターさんのDNAです。
    2004/12 ベンターの世界:ゲノム・ビジネス戦争
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books 遺伝子入門
books マット・リドレー
books 遺伝子研究の未来
books 遺伝子と市民
books 遺伝子とビジネス
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books 関連新刊:
 『DNA多型 Vol.17』 日本DNA多型学会編 東洋書店 (2009/05)
 『バイオ情報学 パーソナルゲノム解析から生体シミュレーションまで』 電子情報通信レクチャーシリーズ 小長谷 明彦著 電子情報通信学会編 コロナ社 (2009/5/26)
 『細胞工学 Vol.28No.6(2009) 特集・疾患エピジェネティクス』 中尾 光善監修 秀潤社 (2009/05)
 『生物の科学遺伝 Vol.63No.3(2009−5月) 特集「植物染色体の最前線」』 エヌ・ティー・エス
 『教科書ではわからない遺伝子のおもしろい話』 じっぴコンパクト 林崎 良英著  実業之日本社 (2009/4/17)
 『種子の科学とバイオテクノロジー』 原田 久也監修 種子生理生化学研究会編 学会出版センター (2009/04)
 『Shall We遺伝学』 Shall Weシリーズ 坂本 尚昭著 講談社 (2009/3/31)
 『光る遺伝子 オワンクラゲと緑色蛍光タンパク質GFP』 マーク・ジマー著 丸善 (2009/3/28)
 『実践ゲノムの最前線 遺伝/医療統計・バイオシミュレーション 個別化医療・遺伝子治療・次世代ナノ医療』 井村 裕夫監修 高岡 裕, 大田 美香, 清野 進, 久野 慎一, 高井 義美, 井村 裕夫(編集) 六然社 (2009/2/10)
ゲノム医学 Vol.9No.1(2009.2) 〈特集〉miRNAをめぐる最近の話題』 「ゲノム医学」編集委員会編集 メディカルレビュー社
 『もしかしたら、遺伝子のせい!? 魚臭くなる病ほか遺伝子にまつわる話』 リサ・シークリスト・チウ著 白揚社 (2009/03)
 『よくわかるDNAと分子生物学 ゼロからのサイエンス』 武村 政春著 日本実業出版社 (2009/2/19)
 『植物ゲノム科学辞典』 駒嶺 穆総編集 朝倉書店 (2009/01)
 『ワトソン組換えDNAの分子生物学 第3版 遺伝子とゲノム』 Amy A. Caudy, Richard M. Myers, James D. Watson, Jan A. Witkowski (著) 丸善 (2009/1/23)
 『DNAロボット 生命のしかけで創る分子機械』 岩波科学ライブラリー153 萩谷 昌己、西川明男著  岩波書店 (2008/12)
 『ヒトゲノムを解読した男 クレイグ・ベンター自伝』 J.クレイグ・ベンター著 化学同人 (2008/12/15)
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news 記事

  ここは過去記事置き場です:報道の経年変化を観察できます。
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2009/06 【日本語記事】Science 酵素の力を借りずに複製するDNA類似体
DNA-Like Molecule Replicates Without Enzyme Help
 原始DNAがどのように複製されていたのかを示唆する研究
 複雑な酵素の力を借りることなく、自らの塩基配列を相補鎖とペアを組めるよう適応させることができるDNA類似体を組み立てる
2009/06 news@nature.com Tantalizing clues to the chemical origins of life
A synthetic molecule can reshuffle itself to match a DNA template.
2009/06 EurekAlert Scripps research team creates simple chemical system that mimics DNA
{ DNAを模倣する} シンプルな化学システム
2009/06 EurekAlert Jumping genes discovery 'challenges current assumptions'
ジャンピング・ジーンがジャンプするとき
 おおかたは精子や卵細胞の発達のときではなく、胎児の発達の間にジャンプする
2009/06 PhysOrg Patenting human genes thwarts research, scientists say
人間の遺伝子の特許権は、研究を妨害する
種子形成下における反復配列の広範な脱メチル化が遺伝子刷り込みの基礎をなす
 シロイヌナズナ(Arabidopsis)の内(胚)乳ゲノムでは広範囲に遺伝子刷り込みが認められる。
2009/06 Science Extensive Demethylation of Repetitive Elements During Seed Development Underlies Gene Imprinting
シロイヌナズナ(Arabidopsis)内(胚)乳のゲノム全体にわたる脱メチル化
 広範囲に遺伝子刷り込みが認められる
2009/06 Science Genome-Wide Demethylation of Arabidopsis Endosperm
生化学:アルキル化DNA損傷のフリッピングが塩基とヌクレオチド除去修復を橋渡しする
2009/06 Nature Flipping of alkylated DNA damage bridges base and nucleotide excision repair
doi:10.1038/nature08076
脱け毛・薄毛の原因遺伝子を特定 国立遺伝学研究所など
 2009/06 朝日新聞 
2009/06 EurekAlert Enzyme necessary for DNA synthesis can also erase DNA
DNA合成に必要な酵素は、DNAを消すことができる
2009/06 EurekAlert Different genes cause loss of body parts in similar fish
異なる遺伝子は、類似した魚で身体部分の減退を引き起こす
 科学者は、{棘魚の2つの種が骨盤と防護服を失った} 方法を比較する
2009/06 【日本語記事】Nature 遺伝:カンジダ属真菌のゲノム比較解析
カンジダ属真菌の6種のゲノム塩基配列
遺伝:カンジダ属真菌8種のゲノムにおける病原性および有性生殖の進化
2009/06 Nature Evolution of pathogenicity and sexual reproduction in eight Candida genomes
doi:10.1038/nature08064
細胞:DNA損傷後には、Fボックスタンパク質FBXO31がサイクリンD1を分解させてG1期停止を引き起こす
2009/06 Nature F-box protein FBXO31 mediates cyclin D1 degradation to induce G1 arrest after DNA damage
doi:10.1038/nature08011
生体内におけるマウスHox遺伝子のエピジェネティックな時間的制御
 注)エピジェネティック:DNAメチル化修飾など、DNAの塩基配列の変化を伴わず、遺伝子の発現を活性化したり不活性化したりする後付けの修飾のこと。
 クロマチン修飾の経時推移に対応して、胚の構造確立に関わるHox遺伝子クラスター内の遺伝子は逐次活性化する。
2009/06 Science Epigenetic Temporal Control of Mouse Hox Genes in Vivo
【英語】「E.O.ウィルソン曰く『ジム・二重らせん・ワトソンは生物学界のカリギュラだ』」
 リンク The Genome: An Outsider's View
 リアル化石を見ずにDNAだけを頼りにして分子生物学が描くオカシナ系統図。
 小麦粉ばかり調べて、実際のパンの種類を見ない、みたいな?
 〜カール・ジンマー
2009/05 BBC News Mouse genome completed
マウス・ゲノム解析完了 Mouse genome laid bare to science
2009/05 EurekAlert Saved by junk DNA
ジャンクDNAによって救われる
 ジャンクDNAの不安定な断片は、遺伝子活動の調整を助け、すばやく生物を環境変化に適応させる。
2009/05 PhysOrg Japan mouse study finds hair-loss gene: researcher
日本マウス研究は、毛-減退遺伝子を発見する:研究者
2009/05 Discovery Hair Loss Gene Found in Mice
マウスで発見される毛減退遺伝子
遺伝:放射線誘発性ヒト遺伝子発現変化の遺伝学的解析
2009/05 Nature Genetic analysis of radiation-induced changes in human gene expression
doi:10.1038/nature07940
計数をおこなう人工遺伝子ネットワーク
 大腸菌(E. coli)において構築された。最大3回までの(細胞外からの刺激によって誘導される)生体応答(すなわち入力シグナル)を計数できる相補的な2つのカウンターモジュール
2009/05 Science Synthetic Gene Networks That Count
並列的なDNA捕獲と塩基配列決定によるヒトゲノム全体のRNA編集部位の同定
注)RNA編集:転写後修飾によりmRNAに塩基の挿入、欠失、置換などが起こる現象
 ヒトゲノムで数百の新規のRNA編集部位が同定された。
2009/05 Science Genome-Wide Identification of Human RNA Editing Sites by Parallel DNA Capturing and Sequencing
プロモーター上の不安定な縦列反復配列が、転写関連の進化可能性を与える
 酵母の遺伝子プロモーター上の不安定なDNA繰り返し配列が、クロマチン構造に作用し遺伝子発現の多様性をもたらす。
2009/05 Science Unstable Tandem Repeats in Promoters Confer Transcriptional Evolvability
細胞:CtIP-BRCA1は細胞周期を通してDNA二本鎖切断修復経路の選択を制御する
2009/05 Nature CtIP-BRCA1 modulates the choice of DNA double-strand-break repair pathway throughout the cell cycle
doi:10.1038/nature07955
脱毛・薄毛の遺伝子発見、キューティクルに異常…国立遺伝学研
 2009/05 読売新聞 
抜け毛:原因遺伝子を発見 マウス実験、治療薬に期待‐‐遺伝研と慶大
 2009/05 毎日新聞 
生理:Bmi1はミトコンドリア機能とDNA損傷応答経路を制御する
2009/05 Nature Bmi1 regulates mitochondrial function and the DNA damage response pathway
doi:10.1038/nature08040
2009/05 BBC News Mouse genome laid bare to science
10年かかってやっとマウス・ゲノム解析やっつけた。
2009/05 EurekAlert Research team finds important role for junk DNA
ジャンクDNAの重要な役割  アクロバチックな働きを展開するトランスポゾン
2009/05 EurekAlert ISU researcher identifies genetic pathway responsible for much of plant growth
植物成長の多くに責任がある遺伝学的な経路を特定
2009/05 【日本語記事】Nature 植物:多年生植物の開花の調節
 アラビス・アルピナ(Arabis alpina)
 多年生植物がもつ3つの重要な形質を調節するPEP1(perpetual flowering 1)遺伝子の同定
植物:多年生植物Arabis alpinaの開花を調節するPEP1
2009/05 Nature PEP1 regulates perennial flowering in Arabis alpina
doi:10.1038/nature07988
shRNA(short hairpin RNA)
2009/05 EurekAlert UCSF creates fast, affordable tool for finding gene 'on-off' switches
遺伝子『オン/オフ』スイッチを発見する手頃なツール
 人間の遺伝子600におけるこれらの「オン/オフ」スイッチのうちの22,000のライブラリを生み出す
エピジェネティクスで(獲得)形質が遺伝する事例はさまざまな生物種で観察されるわけで
2009/05 EurekAlert 100 reasons to change the way we think about genetics
我々が遺伝学についての考えを変えるべき100の理由
ニワトリではヘンゼン結節における細胞の移動により左右非対称な遺伝子発現が構築される
2009/05 Science Cell Movements at Hensen’s Node Establish Left/Right Asymmetric Gene Expression in the Chick
* ニワトリの初期胚における非対称的な遺伝子発現パターンは、細胞の再配置によって受動的に形成される。
MLLの融合パートナーであるTET1によって、哺乳類DNA上の5-メチルシトシンが5-ヒドロキシメチルシトシンに変換される
注1) MLL:myeloid lymphoid leukemia
注2) TET:トリパノソーマタンパク質JBP1、JBP2の哺乳類ホモログ
2009/05 Science  Conversion of 5-Methylcytosine to 5-Hydroxymethylcytosine in Mammalian DNA by MLL Partner TET1
* ゲノムDNAの重要なエピジェネティックマーカーである5-メチルシトシンという塩基は、酵素TET1により5-ヒドロキシメチルシトシンに変換される。
真核生物ゲノムにおける転移酵素(transposase)の機能的な役割 ― 繊毛虫(Oxytricha trifallax)のゲノム再編成での重要な働き
2009/05 Science  A Functional Role for Transposases in a Large Eukaryotic Genome
mammalian Igf2 CpG island, goldfish Igf2 CpG island has a parental differentially methylated region (DMR)
2009/05 EurekAlert The evolutionary foundation of genomic imprinting in lower vertebrates
脊椎下部に見る進化上の遺伝学的土台
2009/05 EurekAlert New tool isolates RNA within specific cells
特定の細胞内のRNAを単離するツール
基本的遺伝子は、新しい機能を獲得する可能性
2009/05 PhysOrg Dogs, maybe not, but old genes can learn new tricks
古い遺伝子が、新しいトリックを学習することができる
生物組織のように柔らかくてタフ:DNAに包まれたカーボンナノチューブ
2009/05 EurekAlert Progress toward artificial tissue?
人工組織の進展?
2009/05 EurekAlert A genome may reduce your carbon footprint
ゲノムは、二酸化炭素を減らす可能性がある
 Acquiring cheap genome sequence data can improve the quality of feedstocks used to create biofuels
 安価なゲノム解析データを得ることによって、生物燃料を生み出すために使用される食品の品質を改善することができる
2009/05 【日本語記事】Nature 遺伝:海で見つかった低分子RNA
 最近開発されたメタトランスクリプトミクスという手法
 培養されているのではない微生物集団のトランスクリプトームをまとめて解析することが可能
遺伝:メタトランスクリプトミクス解析によって明らかになった、海洋水柱中の独自の微生物低分子RNA
2009/05 Nature Metatranscriptomics reveals unique microbial small RNAs in the ocean’s water column
doi:10.1038/nature08055
2009/05 EurekAlert MIT reels in RNA surprise with microbial ocean catch
2009/05 【日本語記事】Nature 損傷の制御:アカパンカビのDNA修復にかかわる低分子RNA群
 Neurospora
  Argonauteタンパク質QDE-2と結合することからqiRNAと名付けられた新種の低分子RNA
細胞:qiRNAはDNA損傷によって誘導される新種の低分子干渉RNAである
2009/05 Nature qiRNA is a new type of small interfering RNA induced by DNA damage
doi:10.1038/nature08041
工学:DNAで作られ制御可能なふたをもつナノスケールの箱の自己集合
2009/05 Nature Self-assembly of a nanoscale DNA box with a controllable lid
doi:10.1038/nature07971
細胞:マップ上の遺伝子エンハンサー
 2009/05 【日本語記事】Nature 
 プロモーターやエンハンサーなどの調節DNAエレメントが、細胞型に特異的な遺伝子発現の決定に果たす役割の解明はあまり進んでいない。
 複数のヒト細胞系列でプロモーターとエンハンサーのヒストン修飾に関するマップを作製
細胞:ヒトエンハンサーにおけるヒストン修飾は広範で細胞型特異的な遺伝子発現を反映する
2009/05 Nature Histone modifications at human enhancers reflect global cell-type-specific gene expression
doi:10.1038/nature07829
タンパク質合成での翻訳:最初から最後まで手を貸す eIF5A
2009/05 Nature Translation: Till termination us do part
doi:10.1038/459044a
2009/05 EurekAlert CSHL scientists discover specific small RNA pathways protect germ line from transposons
細菌株をトランスポゾンから保護する特定の小さいRNA経路
 細菌系統と体細胞は、トランスポゾン防御で異なるpiRNA経路を使用する
2009/05 EurekAlert Researchers find snippet of RNA that helps make individuals remarkably alike
 microRNAのmiR-7は一様性制御を助ける分子ネットワークの健全さに重要である
2009/05 EurekAlert Gene may 'bypass' disease-linked mitochondrial defects, fly study suggests
遺伝子は、パーキンソン病のようなミトコンドリア障害を『迂回する可能性がある』 ― ショウジョウバエでの知見から
2009/05 EurekAlert Stowers researchers develop whole genome sequencing approach for mutation discovery
ショウジョウバエ突然変異マップの「全体ゲノム解析アプローチ」
2009/05 EurekAlert Genetic secrets of date palm unlocked by researchers at Weill Cornell Medical College in Qatar
ナツメヤシの遺伝学的な秘密
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