生物の行動・繁殖シミュレーション について

　　　　　　 ※ 　使ってみてね英語を無料で日本語に自動翻訳するコーナー

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ライオンの群がガゼルを狩るそのさまを、シャーレの中の細菌で再現いたしました
2008/04　EurekAlert　Novel living system recreates predator-prey interaction
　遺伝子組み換えバクテリアを使用した、捕食者と被食者との相互作用を再現する人工生態系

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2008/02　【日本語記事】Nature　生態:野生のレヴィウォーク
捕食者の移動パターンは何によって制御されて自然環境下の捕食者分布が決まっているのか。
　電子タグを用い てウバザメ、ウミガメ、ペンギンなどの海生捕食者の個体移動パターンを100万例以上も収集。
　多くの短いステップとごく少数の長いステップを特徴とするランダムウォーク。
　解析結果は、被食者分布の情報に乏しい捕食者にとって最適と予測される「レヴィウォーク」モデルと一致。
生態:海生捕食者の探餌行動にみられるスケーリング則
2008/02　Nature　Scaling laws of marine predator search behaviour
doi:10.1038/nature06518

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2007/11　New Scientist　Computer programs can help make sense of life
コンピュータープログラムは、生命の理解を促進できる
　 まるで彼らがコンピュータープログラムであるかのようにモデル化されることによって複雑な生命システムの理解が進むだろう

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Modelling for Field Biologists and Other Interesting People
●フィールド生物学者や他の興味ある人々のためのモデリング
　シミュレーションしよう：数学的生態モデリング入門
Hanna Kokko (著)
Cambridge Univ Pr (Sd); 1版 (2007/7/31)
書籍情報と書評：アマゾン 日 　 米 　 英.


「進化と人間行動」の読者は、面白い人々だろうか？
2007/10　Evolution and Human Behavior Volume 28, Issue 6 (November 2007)　ページ448-450
　Are readers of Evolution and Human Behavior interesting people?
　Karthik Panchanathan and Andreas Wilke

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2007/10　Discovery　The Living Cell: Now In 3-D
生きている細胞：３Ｄで
　コンピューターＸ線体軸撮影法に似ている技術を用いて、生きている細胞の三次元イメージをこさえた。

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2007/09　EurekAlert　Primate behavior explained by computer 'agents'
コンピュータ『スパイ』によって解釈される霊長類行動
　霊長類の複雑な行動は、{彼らの行動を模倣する} 人工知能のコンピュータ『代理人』を用いて 理解できる

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フリーライダーが多いシュードモナス菌のコロニーは、ヨソとの競争に負けてしまいますよ
2007/08　EurekAlert　Social parasites of the smaller kind
より小さい種類の社会的な寄生体　微生物の詐欺は、彼ら自身の失脚を組織化する
これらのバクテリアは、環境から鉄を純化するために協力する
Too many cheats spoil the broth
あまりに多くのいかさまは、煮出し汁を損なう

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動物を2、3匹殺しただけで何か影響でも？
2007/07　EurekAlert　Killing only a few animals won't do any harm -- or will it?
　最新の数学的モデリングによって明らかになるその影響
　わずか２〜３匹の生物を殺すだけで、その生態系がガラリ変動することは十分にありえる

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2007/07　PhysOrg　Cheating has long-term consequences in the evolution of cooperation
長期の協力の進化における、ごまかし戦略の重要性
Sam Brownによるニューモデル
　世代を越えて存在する「耐久消費材」にとりつき、やがて崩壊をもたらすチーターたち
2007/07　ScienceDaily　Reap What Your Ancestors Sowed: Cheating Has Long-term Consequences In Evolution Of Cooperation

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2007/05　EurekAlert　Geographer designs computer model to predict crowd behavior
群衆行動を予測するコンピューター・モデル

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2007/02　EurekAlert　Experimental evolution in robots probes the emergence of biological communication
ロボットにおける実験的な進化は、生物学的コミュニケーションの出現を徹底調査する
　evolvableなゲノムを持つバーチャル・ロボットでシミュレーションしてみました
2007/02　New Scientist　Robot swarms 'evolve' effective communication

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2006/06　Discovery　Computer 'Beings' Evolve as Society
　A massive computer project simulates society and evolution.

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進化 : 協力行動はどうやって社会に出現・定着したか
2006/04　【日本語記事】　Nature＠日本
M.BurtsevとP.Turchinによるゲームシミュレーション
「カラス」ヨソモノとは戦い、同類とは仲良く
「ムクドリ」群で他者排除、資源を共有

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2005/10　Discovery　Machines Behave Like DNA
The miniature robots pair up on an air hockey table, then decide whether to stay together.

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2005/09　Discovery　Ant-Like Robots Begin to Colonize
Swarms of tiny robots could someday behave like colonies of ants.

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野に出るロボットたち 　動物行動を動物型ロボットを使って調べる研究が盛んになってきた
2005/06　【日本語記事】　Nature＠日本

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「自力で歩く生物」を創造するアーティスト
2005/01　【日本語記事】　ワイアードジャパン

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試されるダーウィンの理論：デジタル・エイリアンの世界
2005/01　carlzimmer.com　TESTING DARWIN

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2005/01　Wired　Life, Reinvented
　A group of MIT engineers wanted to model the biological world. But, damn, some of nature's designs were complicated! So they started rebuilding from the ground up - and gave birth to synthetic biology.

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サバイバル・ゲーム：ゲーム理論が説明する人間の協力行動と競争の生物学 　デイヴィッド・バラシュ
The Survival Game: How Game Theory Explains the Biology of Human Cooperation and Competition
　David P. Barash (著)
　ハードカバー: Henry Holt and Co ; ISBN: 080507175X ; 1st 版 (2003/12)
　ペーパーバック: Owl Books ; ISBN: 0805076999 ; (2004/09)
※バラシュ： 不倫のDNA―ヒトはなぜ浮気をするのか

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2004/09　Evolution and Human Behavior Volume 25, Issue 5, Pages 277-353
　Cultural evolution in laboratory microsocieties including traditions of rule giving and rule following

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気に病む人工知能？ 　プログラムに不安感を与えるとコンピュータの人間行動予測が向上する
2004/09　EurekAlert　Giving computers the jitters helps explain human behavior

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理論生物学：サイバースペースの茸
2004/09　Nature 431, 32　Theoretical biology: Mushrooms in cyberspace

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モブが自然発生するとき　ベルリンの壁倒壊前の群衆発生
　コンピューター・モデルが示す：社会的ネットワークによる意思決定メカニズムの侵食
2004/08　EurekAlert　Study shows how consensus is attained in a noisy world

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2004/07　Michigan State University　Digital evolution reveals the many ways to get to diversity

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バーチャルエコロジーで受賞を目指せ
　ホノロコ　Honoloko 　島の仮想生態系ゲームで環境問題感覚を身につけよう
2004/06　BBC News　Virtual island way to green life

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絶滅の予測は一筋縄ではいかない　乱された生物群集がどう振る舞うかシミュレート
2004/05　【日本語記事】　Nature＠日本
生態：食物網の相互作用が非ランダム性絶滅の後の群集の抵抗性を左右する
2004/05　Nature 429, 174 - 177　Food-web interactions govern the resistance of communities after non-random extinctions
2004/05　EurekAlert　Study examines future of species extinction, conservation

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2004/06　【日本語記事】　EP: end-point　訃報：ジョン・メイナード・スミス

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パロアルト研究所、シロアリの生態を手本に給紙装置を開発中
2003/09　【日本語記事】　ワイアードジャパン

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2003/09　Nature Science Update　Panicking mice find flaws in exit routes
　 Rodents hint at how people flee from a crowded room.
2003/09　Nature Science Update　Stampeding mice behave like fleeing humans

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2003/07　Nature Science Update 　Artificially evolved protein destroys nerve gas
　Bacterial enzyme tweaked to dismember chemical-warfare agent.

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2003/07　New Scientist　Circuit design evolving in distributed digital world

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メイナード・スミス　インタビュー
2003/06　New Scientist　Games and theories

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2003/02　J Cogn Neurosci 2003 Feb 15;15(2):194-208
　A computational study into the evolution of dual-route dynamics for affective processing.

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生物工学：新規機能をもつ受容体およびセンサータンパク質のコンピューターによる設計
2003/05　Nature 423, 185 - 190
　Computational design of receptor and sensor proteins with novel functions
2003/05　Duke University 　Engineered Proteins Will Lead to 'Synthetic Biology'

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デジタル生物が進化論を後押し
2003/05　【日本語記事】　Nature Japan
複雑な特徴の進化の起源
2003/05　Nature 423, 139 - 144　The evolutionary origin of complex features
2003/05　National Science Foundation
　Artificial Life Experiments Show How Complex Functions Can Evolve
2003/05　EurekAlert 　ALife experiments show how complex functions can evolve
2003/05　New Scientist 　'Digital organisms' evolve complex functions in short steps
2003/05　National Geographic 　Virtual Life-Forms Mutate, Shedding Light on Evolution
2003/05　MSNBC　Cyber-life obeys Darwinian theory

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DNAコード、4塩基より多くても少なくても生物進化は難しげ 　コンピュータ・シミュレーション
2003/04　BBC News　Why we are not like ET

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2003/03　National Science Foundation 　From Biology to Computing and Back Again

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MIT名物の長い廊下に、巨大なバーチャル水族館を
2003/03　【日本語記事】　ワイアードジャパン

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ヒト行動シミュレーション
2003/02　Cornell University 　Artificial worlds used to unlock secrets of real human interaction

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計算生物学：進化の方向は運任せ？
2002/12　Nature 420, 756- 757　Computational biology: Evolution plays dice
自己複製するコンピュータープログラムを用いる大進化のシミュレーション
2002/12　Nature 420, 810 - 812
　Macroevolution simulated with autonomously replicating computer programs

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バーチャル細胞のソフト作ります　がん治療など目的に
2002/11　【日本語記事】　asahi.com : 科学・自然

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2002/11　National Science Foundation
　Using Computers, Scientists Successfully Predict Evolution of E. Coli Bacteria

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2002/11　University of California 　UCSD BIOENGINEERS DEVELOP FIRST COMPUTER MODEL THAT PREDICTS DISEASE VARIANT BASED ON GENETIC DEFECT

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2002/11　Nature Science Update　Gorillas go into virtual reserve
　Computer model of mountain forest to keep track of threatened apes.

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組織化原理　遺伝子にも神経網にもインターネットにも適用できるよ
2002/11　EurekAlert!
　Genes, neurons, and the Internet found to have some identical organizing principles

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最後の進化 ‘ロボット生態系’ 　動物に似ている生体模倣ロボットたち
　‘こつこつと’… 生物体の運動性明らかにして機械的に具現
2002/10　▼韓国語和訳　ハンギョレ21（Naver経由）

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2002/10　Trends in Ecology and Evolution Vol. 17, No. 11 　The biology of digital organisms

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機械の中の自然　バイオなコンピューティングの近未来
Machine Nature: The Coming Age of Bio-Inspired Computing
　Moshe Sipper (著) 　ハードカバー(2002/07)　McGraw-Hill Trade　ISBN: 0071387048
書籍情報と書評：アマゾン 日　 米　 英
2002/09　New Scientist

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カーニバルでのヒトの流れをアリからシミュレート
2002/08　Nature Science Update 　Ants shape Europe's biggest carnival
ヒトもアリも群れれば同じ 　群衆の行動を昆虫群のモデルを使って予測する
2002/09　【日本語記事】　ネイチャーバイオニュース

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利己的遺伝子蔓延の系統的な証拠
2002/08　Proc. Natl. Acad. Sci. USA, Vol. 99, Issue 17, 11265-11269
　Genealogical evidence for epidemics of selfish genes

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進化シミュレーション
2002/08　Ananova　Scientists plot evolution of virtual creatures
2002/08　New Scientist　'Animals' grow from an artificial embryo
2002/08　The Scientist　Evolution at Warp Speed
　Two groups take on catalysis with in vitro evolution

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2002/08　EurekAlert! 　Computational geneticists revisit a mystery in evolution

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コンピュータ・ウィルスの動向、病原ウィルスによく似ています
2002/06　Ananova　Computer bugs 'mirror human viruses'

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バーチャル生物学
Digital Biology　　Peter J. Bentley (著)
　ハードカバー (2002/01) Simon and Schuster Books ; ISBN: 0743204476
　Paperback (March, 2002) Review; ISBN: 0747266549
書籍情報と書評：アマゾン 日　 米　 英
2002/03　New York Times　Is This Chip Educable?

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人工知能ロボットに生存競争をさせる壮大な実験
2002/02　▲日本語記事　ワイアードジャパン

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バーチャル蛾の模様、天敵の目が進化させるんです
2002/02　Ananova　Virtual moths 'evolve' in lab
2002/02　EurekAlert! 　Predators drive evolution of virtual prey appearance
2002/02　Nature News Service　Computerized moths diversify to survive.
仮想獲物の隠蔽色と多型性は視覚捕食者によって選択される
2002/02　Nature 415, 609 - 613
　Visual predators select for crypticity and polymorphism in virtual prey

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まれびとを歓待してどんな利益があるの？
　そのわけはミームにあった！ 　良きサマリア人はなぜヒト社会にしかいないのかシミュレーション
2001/12　Telegraph　Why be a Good Samaritan?

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進化：我慢の風潮
2001/11　Nature 414: 6862 　Evolution: Tides of tolerance
相互利益のない協同作用の進化
2001/11　Nature 414: 6862 　Evolution of cooperation without reciprocity

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進化シミュレーション
Creative Evolutionary Systems 　Peter J. Bentley (編集), David W. Corne (著)
　ハードカバー CD-ROMつき(2001/07) Morgan Kaufmann Publishers, Inc. ; ISBN: 1558606734
書籍情報と書評：アマゾン 日　 米　 英
2001/07　Morgan Kaufmann Publishers 　Creative Evolutionary Systems

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生物の進化をデジタルシミュレーション
2001/07　EurekAlert! 　Digital organisms used to confirm evolutionary process
2001/07　San Francisco Chronicle 　Digital critters mimic behavior of real life 　Researchers use them to test Darwin's theories
変異率の高いデジタル生物を進化させると適応度のピーク状態が最も長く持続するものが生き残る
2001/07　Nature 412: 6844 Page 331 　Evolution of digital organisms at high mutation rates leads to survival of the flattest

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淘汰、組み換え、突然変異の数学理論
The Mathematical Theory of Selection, Recombination, and Mutation (Wiley Series in Mathematical and Computational Biology)
　Reinhard Burger (著) 　ハードカバー (2000/10) John Wiley and Sons (Sd) ; ISBN: 0471986534
アマゾン書籍情報： 日　 米　 英

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ロボットと生物行動シミュレーション
2001/06　bbsonline.org 　Can robots make good models of biological behaviour?

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計算機生物学：生き生きとした記述へ
2001/05　Nature 411: 6834 Page 151 　Computational biology: Beyond the spherical cow

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動物行動学と行動シミュレーション
2000/11　 Animal Behaviour Vol. 60, No. 5, pp. 545-558 　What does robotics offer animal behaviour?

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捕食者と被捕食者の個体数増減関係を予測する法則
2000/11　 North Carolina State University 　Researchers establish formula for predicting predator-prey populations

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エゴイストのなりゆき 　進化に関する新しいコンピュータモデル
2000/10　▲日本語記事　ネイチャーバイオニュース

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アリロボットのリクルート行動 　進化し社会性を持つ機械たち
2000/09　▲日本語記事　ネイチャーバイオニュース

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ずるい奴が栄える 　進化の過程で優遇されるタイプとは？
2000/04　▲日本語記事　ネイチャーバイオニュース

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